在财务经营管理方面，新疆地调处在加强预算管理的同时，制定了多项措施，把好成本控制关。他们坚持紧缩银根的政策，严格控制非生产性支出；可变费用指标下浮，从处领导和机关带头做起；将常规项目、攻关项目和科研项目捆绑运作，费用计划单列，成本跟踪分析；对具备条件的附属单位和下设单位实行费用预算合并编制，减少固定费用投入；员工内部流动时，办公设备随人走，减少费用支出；控制机构规模和人员数量，推行合署办公，减少办公场所租赁费；结合生产实际，适度封存小车队车辆，降低成本；推行靠前培训、网络培训，降低培训成本；实行各单位和财务部门共同把关，严格预算管理；严格奖惩，根据各单位完成指标情况考核兑现。此外，新疆地调处在各单位开展了“开源、节流、增效”大讨论，集思广益，压力共担，确保企业实现良好的经营业绩。上级和地方中介审计部门在对新疆地调处进行审计时，多次给予较高评价，认为该处成本列支渠道正确，费用计提比例准确，无差异调整事项。